I primi cinque anni del nuovo secolo mostrano il solito declino produttivo degli anni Novanta in termini quantitativi, dovuto ai gravi problemi economici dell’Isola dopo la fine del blocco socialista, che non risparmiano il cinema. Nello stesso tempo si registra un vuoto incolmabile di tipo qualitativo per la scomparsa di alcuni tra i migliori registi cubani come Tomás Gutiérrez Alea, Santiago Álvarez e Humberto Solás. Alfredo Guevara, uno dei principali fondatori del progetto ICAIC, si è dimesso da presidente dell’Istituto Cinematografico Cubano ma dirige ancora il Festival Internacional del Nuevo Cine Latinoamericano. All’interno dell’ICAIC è stato costituito il Comitato dei Progetti, un’organizzazione utile per sostenere la creatività degli autori nazionali, così come sono importanti le Mostre Nazionali dei Nuovi Registi. Juan Carlos Tabío è ancora molto attivo e si impegna in due coproduzioni di successo con la Spagna (Lista de espera e Aunque estés lejos), mentre Fernando Pérez e Humberto Solás, sempre grazie a coproduzioni e con mezzi molto scarsi, hanno accentuato la loro poetica personale con Suite Habana e Miel para Oshún. Tra scarsità di risorse e problemi di vario tipo, riescono a girare qualche pellicola registi a lungo inattivi e realizzano le prime fiction alcuni documentaristi di valore come Enrique Colina, Juan Carlos Cremata e Rigoberto López.
Le pellicole più importanti del periodo: ¡Van Van empezó la fiesta! (2000 – doc.), Hacerse el sueco (2000 – fiction), Lista de espera (2000 – fiction), Leo Brouwer (2000 – doc.), Motos (2000 – fiction), Las sombras corrosivas de Fidelio Ponce aún (2000 – doc.), Bien dentro de mí (2000 – doc.), Estado de gracia (2000 – doc.), Al atardecer (2001 – fiction), Miradas (2001 – fiction), Nada (2001 – fiction), Miel para Oshun (2001), Las noches de Constantinopla (2001 – Fiction), Con todo mi amor, Rita (2001 – doc.), … De mi alma, recuerdos (2001 – doc.), Hasta que la muerte nos separe (2001 – doc.), Luis Carbonell (después de tanto tiempo) (2001 – doc.), No me voy a defender (2001 – doc.), Doble juego (2002 – fiction), Santa Camila de La Habana Vieja (2002 – fiction), El sueño y un día (2002 – fiction), Video de familia (2002 – fiction), Mujer, alma de maravilla (2002 – doc.), Secretos de la jungla (2002 – doc.), Mirame, mi amor (2002 – doc.), Son 43 (2002 – doc.), … porque vivir es un testimonio raro (2002 – doc.), Las manos y el ángel (2002 – doc.), Así como soy (2003 – doc.), Habana abierta (2003 – doc.), Roble de olor (2003 – fiction), Aunque estés lejos (2003 – fiction), Entre ciclones (2003 – fiction), Más vampiros en La Habana (2003 – fiction), Suite Habana (2003 – doc.), Dominó dominò (2003 – fiction), Dos miradas (2003 – doc.), Sara Gonzáles (2003 – doc.), Paloma de papel (2003 – doc.), Hormigas en la boca (2004 – fiction), tres veces dos (2004 – fiction), Sube y baja (2004 – doc.), Del Río, Zaida (2004 – doc.), Cuba: Caminos de Revolución (2004 – doc.), Perfecto amor equivocado (2004 – fiction), Viviendo al limite (2004 – doc.), Viva Cuba (2005 – fiction), Mi Caballero de París (2005 – fiction), Espectros (2005 – fiction), La memoria de los árboles (2005 – fiction), Santa Cecilia (2005 – fiction), Ivette (2005 – doc.), Montaña de luz (2005 – doc.), Donde no habita el olvido (2005 – doc.), LLegó el tresero (2005 – doc.), Barrio Cuba (2005 – fiction), Bailando Cha cha cha (2005 – fiction), El Benny (2006 – fiction), Fredie (2006 – fiction), Mañana (2006 – fiction), La pared (2006 – fiction), Viaje de un largo día hacia la noche (2006 – fiction), El Proceso: la historia no contada (2006 – doc.), De lado de la esperanza (2006 – doc.), El futuro es mi sueño (2006 – doc.), Mujeres de guerrilla (2006 – doc.), San Ernesto nace en La Higuera (2006 – doc.), Servando en tres tiempos (2006 – doc.), ¡Vampiros! (2006 – doc.), Páginas del diario de Mauricio (2006 – fiction), Monteros (2006 – doc.), A tempo (2006 – doc.), Camino al Edén (2007 – fiction), Poética gráfica insular (2007 – doc.), La edad de la peseta (2007 – fiction), Madrigal (2007 – fiction), Otra pelea cubana contro los demonios… y el mar (2007 – doc.), La noche de los inocientes (2007 – fiction), Memoria de la fiebre (2007 – doc.), Son para un sonero (2007 – doc.), Miranda regresa (2007 – fiction), Donde habita el corazón (2007 – doc.), Kangamba (2008 – fiction), El viajero inmóvil (2008 – fiction), A história va a ser contada de nuevo (2008 – doc.), Omertá (2008 – fiction), La dimensión de las calabra (2008 – doc.), Fuera de liga (2008 – doc.), Miguel Barnet: un animal de sueños (2008 – doc.), Él, ustedes, nosotros (2008 – doc.), Hombres sobre cubierta (2008 – doc.), Marcos Madrigal in crescendo (2008 – doc.), Cuerda y percusión (2008 – doc.), Personal Belongings (2008 – fiction), Nos queda su canción (2008 – doc.), Destinos (2008 – doc.), Volveré y seré millones (2008 – doc.), Bretón es un bebé (2008 – doc.), El charenton del Buen Día (2008 – doc.), Gibara, ciudad abierta (2008 – doc.), La Anunciación (2009 – fiction), Los dioses rotos (2009 – fiction), El premio flaco (2009 – fiction), Ciudad en rojo (2009 – fiction), El cuerno de la abundancia (2009 – fiction), Del amor y los muertos (2009 – doc.), Lisanka (2009 – fiction), Séptima estación (2009 – doc.), El despertar de un sueño (2009 – doc.), ¡Ay mi amor! (2009 – fiction), De la sabiduría (2009 – fiction), Pueblo a pueblo (2009 – doc.), Dentro de 50 años (2009 – doc.), Nunca será fácil la herejía (2009 – doc.), Salvador de Cojímar (2009 – doc.), Benny Moré; la voz entera del Son (2009 – doc.), José Martí: el ojo del canario (20010 – fiction), Los Noticieros ISAIC y sus voces (2010 – doc.), En el cuerpo equivocado (2010 – doc.), El más fuerte (2010 – fiction), Con dos que se quieran (2010 – doc.), Temperamento (2010 – doc.), Al día siguiente (2010 – fiction).